由于“大干快上”,国内期货交易所才一年多时间就达到50多家,期货经纪公司300多家,期货兼营机构2000多家。各地一哄而起办期货市场暴露出一系列问题:交易品种严重重复、严重过度投机、市场操纵频发;期货经营机构运作不规范,无法可依,管理混乱;盲目发展境外期货,地下交易盛行,经济纠纷和社会问题频发。当时的情况用十二个字总结就是:“无序发展、无法可依、无人监管”。因此从1993年开始,我国开始了对期货市场的第一轮清理整顿。
1993年11月,国务院发布《关于坚决制止期货市场盲目发展的通知》,明确了“规范起步,加强立法,一切经过试验和严格控制”的原则,标志着第一轮清理整顿的开始。
十四届三中全会审议通过了《中共中央关于建立社会主义市场经济体制若干问题的决定》,严格规范少数商品期货市场试点。
1995年6月李鹏同志讲话提到,“期货,最突出的是投机过度,期货价格炒的过高,并且对现货市场产生了连带影响。......只留几个小品种继续试验”。这也是为什么在2004年之前或者说本世纪初我国只有少数几个期货品种的原因。
1995年和1997年,期货市场发生了两件大事。1995年2月23日,327国债期货事件,万国证券整顿,并入申银证券,改名申银万国证券,金融期货停止交易。1997年,湖南株洲冶炼厂在伦敦金属交易所进行锌期货交易时发生巨额亏损,亏损金额达14.6亿元。这件发生在境外期货交易市场的事件后来被称为“株冶期货风险事件”。这两件事导致期货市场的“坏名声”经久不散。
此后国家逐渐强化对期货市场的规范和整顿。1998年8月,国务院发布了《关于进一步整顿和规范期货市场的通知》,坚持“继续试点,加强监管,依法规范,防范风险”的原则,正式拉开了第二轮清理整顿的序幕。
1999年6月,国务院颁布《期货交易管理暂行条例》,它标志着期货市场终于从“无法运行”阶段进入“有法运行”阶段。这是期货市场发展的一个标志性的法规。至此,中国期货市场监管机构明确为中国证监会。
由中国证监会集中统一监管期货市场,全国各地的期货交易所经过整顿和撤并,由50多家逐步减少,最终仅剩三家——上海期货交易所、郑州商品交易所和大连商品交易所(直至2006年中国金融期货交易所成立,成为全国第4家期货交易所)。期货交易所也作为证监会的会管单位纳入系统管理。
对期货交易的规则也进行了调整,停止了大量品种的交易,并提高了部分保留品种的交易保证金比例。最终有交易的只有上海期货交易所的铜和铝,郑州商品交易所的小麦和大连商品交易所的大豆四个期货交易品种。但郑商所把小麦分成了强筋小麦和硬小麦,大商所把大豆分成大豆一号和大豆二号,所以实际有交易量的不止4个。另外还有几个保留的品种,如天然橡胶、早籼稻、绿豆等,但由于提高了保证金比例,实际上停止了交易。